Mulder ve Doggett, uzaylıların emprenye edilmesini denediğinden şüphelenilen doktorlardan birinin öldürüldüğü bir genetik laboratuvarına yapılan kundaklama saldırısını araştırmak için güçlerini birleştirir. Yakın zamanda kaçırılmasının ardından uzaylı bir kopyasına dönüşen ve testlerin kanıtlarını silmeye çalışan Billy Miles ile karşılaşırlar. Scully'ye evde yardım eden bir kadının komplonun bir parçası olduğu anlaşıldığında, ajanlar, Monica Reyes ve Alex Krycek ile birlikte Scully ve bebeğini Billy Miles'tan korumaları ve onu şehirden çıkarmaları gerektiğini bilirler.